健脾益气法对DEN大鼠肝癌后基因组转录调控的生物信息学分析

被引：13

作者：

卓少元 ^{[1
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方肇勤 ^{[2
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管冬元 ^{[2
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吴中华 ^{[2
]}

高必峰 ^{[3
]}

机构：

[1] 广西中医药大学

[2] 上海中医药大学

[3] 科罗拉多大学医学院

来源：

时珍国医国药 | 2014年 / 25卷 / 07期

关键词：

肝癌; 健脾益气治法; 基因; 生物信息学;

D O I：

暂无

中图分类号：

R273 [中医肿瘤科];

学科分类号：

100502 [中医临床基础];

摘要：

目的研究健脾益气法对DEN大鼠肝癌基因表达谱的影响,初步探讨健脾益气法治疗肝癌的分子机制。方法利用affymetrix NetAffxTM、DAVID和STRING等在线分析软件,对前期用Affymetrix Rat 230A GeneChip arrays检测到的不同中医治法干预后的DEN大鼠肝癌基因表达谱进行生物信息学分析。结果健脾益气法对肝癌基因表达的调节要明显优于其它治法,其调节的差异基因440个,包括上调表达130个和下调表达310个。这些差异基因编码蛋白在生物学过程中主要参与对有机物的应答反应和胞外刺激反应,在分子功能上主要参与特定蛋白的结合,而在信号通路中主要参与Gq蛋白激活的花生四烯酸-HETEs代谢通路;这些差异蛋白的相互作用主要集中在Adcy3、Gnao1、Tgfb1、Vim等15个基因的表达产物,结合文献挖掘发现健脾益气法对肝癌基因表达的调节主要表现在对TGF-β1诱导的上皮-间质转化(EMT)的下调、cAMP含量的上调和PPARα等核受体的逆向调节等,其中以TGF-β1-EMT蛋白网络相关分子在DEN大鼠肝癌中的表现及健脾益气法对其下调作用最明显。结论健脾益气法对DEN肝癌大鼠的治疗是多方位的;对TGF-β1诱导的肝癌EMT过程和Gq蛋白激活的花生四烯酸-HETEs代谢通路的下调作用可能是健脾益气法治疗肝癌的重要机制。

引用

页码：1765 / 1768

页数：4

共 7 条

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