江苏无锡健康与肠病人群肠道脱硫弧菌数量及肠道菌群多样性

被引:49
作者
丁俊荣
张秋香
刘小鸣
王刚
田丰伟
张灏
陈卫
机构
[1] 江南大学食品学院食品生物技术中心
关键词
荧光定量PCR; DGGE; 脱硫弧菌; 肠道疾病; 16S rRNA; dsrB;
D O I
10.13343/j.cnki.wsxb.2012.08.013
中图分类号
R574 [肠疾病];
学科分类号
100201 [内科学];
摘要
【目的】研究息肉、溃疡性结肠炎、直肠结肠癌和健康人群肠道中脱硫弧菌数量的差异,及不同人群肠道菌群的多样性,分析脱硫弧菌数量及肠道菌群多样性与肠道疾病之间的潜在关系。【方法】采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)的方法,对58名受试者肠道脱硫弧菌的数量进行定量分析。采用PCR-DGGE技术,对不同人群的肠道脱硫弧菌和肠道菌群结构进行分析,结合16S rRNA V3区测序分析不同人群肠道菌群多样性的差异。【结果】RT-PCR分析显示,所有受试者均为脱硫弧菌阳性,其中息肉(2.9×106cfu/mL)和溃疡性结肠炎人群(1.2×106cfu/mL)肠道中脱硫弧菌的数量明显高于健康人群(7.0×105cfu/mL),直肠结肠癌人群(6.8×105cfu/mL)肠道中脱硫弧菌的数量与健康人群无明显差异。DGGE图谱聚类分析结果表明,肠道疾病人群肠道中脱硫弧菌的菌群相似度较高,而与健康人群之间的差异较大。16S rRNA V3区基因测序显示肠道疾病人群与健康人群在肠道菌群多样性和优势菌群方面均有明显差异。【结论】通过RT-PCR与DGGE相结合的方法,说明肠道脱硫弧菌数量的增多是息肉和溃疡性结肠炎疾病的一个重要特征,且其菌群组成在肠道疾病人群与健康人群之间存在明显差异。与健康人群相比,肠道疾病人群的肠道微生物多样性升高,优势菌群发生偏移,菌群失衡。
引用
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[1]
Desulfovibrio Bacterial Species Are Increased in Ulcerative Colitis [J].
Rowan, Fiachra ;
Docherty, Neil G. ;
Murphy, Madeline ;
Murphy, Brendan ;
Coffey, John Calvin ;
O'Connell, P. Ronan .
DISEASES OF THE COLON & RECTUM, 2010, 53 (11) :1530-1536
[2]
Quantification of Gram-negative sulphate-reducing bacteria in rice field soil by 16S rRNA gene-targeted real-time PCR [J].
Stubner, S .
JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS, 2004, 57 (02) :219-230
[3]
Sulfate-reducing bacteria in human feces and their association with inflammatory bowel diseases [J].
Loubinoux, J ;
Bronowicki, JP ;
Pereira, IAC ;
Mougenel, JL ;
Le Faou, AE .
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 2002, 40 (02) :107-112
[4]
Bacteroides of the Human Lower Intestinal Tract.[J].A A Salyers.Annual Review of Microbiology.1984,