基于生物信息学的桂枝芍药知母汤治疗RA的作用机制

目的:运用生物信息学分析方法探究桂枝芍药知母汤(GZSYZMT)治疗类风湿性关节炎(RA)的潜在作用机制。方法:利用中药综合数据库(TCMID),草药成分靶点数据库(HIT),台湾中药数据库(TCM Database@Taiwan)查找GZSYZMT中每味中药的活性成分及其靶蛋白,从国家生物技术信息中心(NCBI)获取RA的相关靶点基因;将上述数据集导入装载Reactome FIViz app 5插件的Cystoscape 3.2.1软件,分别构建GZSYZMT分子相互作用网络和RA靶点相互作用网络,分析其生物学过程和生物学功能;对比分析两者的分子网络和主要生物学过程,结合相关生物学信息探讨GZSYZMT治疗RA的作用机制。结果:GZSYZMT和RA的生物学过程和功能均与免疫反应、炎症反应、细胞信号转导、细胞增殖与凋亡相关;共同交联靶分子包括IL-2,HRAS,IL-6,CD14,CD40,PRKCB,BTK等37个,共同生物学通路包括toll-like receptor signaling pathway,NF-κB signaling pathway,MAPK signaling pathway,TNF signaling pathway,NOD-like receptor signaling pathway等35对。结论:基于生物信息学的分析方法可预测GZSYZMT治疗RA的作用机制;GZSYZMT可能通过调控IL-2,HRAS,IL-6,CD14,CD40等多个靶点,TLR-NF-κB信号通路,TLR-MAPKs信号通路,TNF信号通路,NLR信号通路等多个途径发挥治疗RA的作用。