H9N2亚型禽流感病毒基因组全长序列测定和各基因的遗传分析

用RT PCR技术及cDNA末端快速扩增法获得禽流感病毒分离株A Chicken Shanghai F 98(H9N2 )代表基因组全长的 8个基因片段。基因组序列比较及遗传进化分析结果表明 ,Chicken Shanghai F 98的 8个基因均不属于Quail HongKong G1 97亚系 ,与香港禽流感事件没有直接关系。它与Chicken Beijing 1 94的HA、NA、M、NS基因同源率分别为 96 7%、96 4%、97 5 %和 98 0 % ,这 4个基因属于Chicken Beijing 1 94亚系 ,其中 ,NA基因与Duck HongKong Y2 80 97的同源率为 97 4% ,而且它们均在 2 0 5位后缺失 9个核苷酸。而PB2、PB1、PA和NP基因与已知的 3个亚系关系较远 ,分别在相应的进化树上另成分支。因此 ,Chicken Shanghai F 98是两个以上不同基因亚系间发生自然重排的产物。