改进的势能曲面变平法在二维非格点模型中的应用

被引：4

作者：

刘景发 ^{[1
,2
]}

陈端兵 ^{[3
]}

刘朝霞 ^{[1
]}

机构：

[1] 南京信息工程大学计算机与软件学院

[2] 衡阳师范学院数学系

[3] 电子科技大学计算机科学与工程学院

来源：

计算机科学 | 2008年 / 10期

关键词：

蛋白质结构预测; 非格点模型; Monte Carlo方法; ELP方法;

D O I：

暂无

中图分类号：

TP399-C8 [];

学科分类号：

摘要：

蛋白质结构预测问题是生物信息学中的一个重要问题。缺少一种有效的全局寻优方法是阻碍这一问题解决的关键。势能曲面变平(ELP)法是一种启发式的全局优化方法,是一种推广的Monte Carlo方法,已成功地应用于许多优化问题。在ELP法的基础上,提出了改进的势能曲面变平(ELP+)算法。将ELP+算法应用于二维非格点的蛋白质AB模型,预测和发现四条链长分别为13,21,34和55的氨基酸序列的蛋白质结构。数值实验表明,ELP+算法是一种预测蛋白质结构的有效算法。

引用

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