利用正交设计优化烟草SRAP反应体系

被引:30
作者
陈万胜
王元英
罗成刚
杨爱国
蒋彩虹
范静苑
机构
[1] 中国农业科学院烟草研究所
关键词
烟草; SRAP; 正交设计; 优化;
D O I
暂无
中图分类号
S572 [烟草(菸草)]; Q943.2 [植物基因工程];
学科分类号
0901 ; 071007 ; 090102 ;
摘要
利用正交设计L16(45)对烟草SRAP-PCR反应体系的五因素(Taq酶,Mg2+,模板DNA,dNTP,引物)在四个水平上进行优化试验,PCR结果用统计软件SPSSV13.0分析,得出如下结论:各因素的不同水平对PCR反应结果都有显著的影响,其中Taq酶量影响最大;筛选出各反应因素的最佳水平,建立烟草SRAP-PCR反应的最佳体系(25μL)为:Taq酶1.0U,Mg2+1.5mmol/L,模板DNA30.00 ̄120.00ng,dNTP0.1mmol/L,引物0.40μmol/L。最后,应用烟草SRAP-PCR最佳反应体系对PCR扩增程序中的退火温度及循环次数进行了筛选,得出SRAP-PCR扩增以52℃退火温度、35个循环次数为最佳。这一优化系统的建立为今后利用SRAP标记技术对烟草进行基础研究提供了一个标准化的程序。
引用
收藏
页码:177 / 182
页数:6
相关论文
共 6 条
[1]   棉花SRAP遗传连锁图构建 [J].
林忠旭 ;
张献龙 ;
聂以春 ;
贺道华 ;
吴茂清 .
科学通报, 2003, (15) :1676-1679
[2]  
生物化学与分子生物学实验常用数据手册[M]. 科学出版社 , 吴冠芸等主编, 1999
[3]  
Comparative analysis of seeded and vegetative biotype buffalograsses based on phylogenetic relationship using ISSRs, SSRs, RAPDs, and SRAPs[J] . H. Budak,R. C. Shearman,I. Parmaksiz,I. Dweikat.Theoretical and Applied Genetics . 2004 (2)
[4]   Gene for gene alignment between the Brassica and Arabidopsis genomes by direct transcriptome mapping [J].
Li, G ;
Gao, M ;
Yang, B ;
Quiros, CF .
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2003, 107 (01) :168-180
[5]   Genetic diversity of a germplasm collection of Cucurbita pepo using SRAP and AFLP markers [J].
Ferriol, M ;
Picó, B ;
Nuez, F .
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2003, 107 (02) :271-282
[6]  
Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica[J] . G. Li,C. F. Quiros.TAG Theoretical and Applied Genetics . 2001 (2-3)