荔枝SRAP-PCR反应体系的优化

被引：12

作者：

昝逢刚 ^{[1
,2
]}

吴转娣 ^{[1
,2
]}

曾淇 ^{[1
,2
]}

张惠云 ^{[2
]}

李明芳 ^{[1
]}

郑学勤 ^{[1
]}

机构：

[1] 中国热带农业科学院热带生物技术研究所

[2] 海南大学

来源：

基因组学与应用生物学 | 2009年 / 28卷 / 01期

关键词：

荔枝; SRAP-PCR反应体系; 优化;

D O I：

暂无

中图分类号：

S667.1 [荔枝];

学科分类号：

090201 ;

摘要：

SRAP(sequence-related amplified polymorphism)是基于基因的内含子和外显子区域进行检测的新型分子标记技术,具有多态性高、重复性好、易测序、便于克隆目标片段等特点,在荔枝(Litchi chinensis Sonn)中还没有相关的研究报道。为了建立适合荔枝的SRAP反应体系,对反应体系中的DNA模板、Mg2+、dNTP、引物、Taq DNA聚合酶诸因子的用量进行了探索,确立了适合荔枝的SRAP反应体系为:在20μL反应体系中,模板DNA为40ng,Mg2+浓度2.5mmol/L,dNTP0.3mmol/L,引物5mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0U。扩增程序为:94℃预变性3min,反应前5个循环在94℃ 1 min、35℃ 1 min、72℃ 1 min的条件下运行;随后的35个循环退火温度提高到50℃;最后72℃延伸10min。利用该反应体系对荔枝10个不同品系进行SRAP反应,用5%的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,结果显示:不同品系间DNA谱带多态性丰富。证实该体系稳定可靠,可以用于荔枝的分子标记研究。

引用

页码：132 / 136

页数：5

共 8 条

[1] 应用SRAP标记对莲藕资源的聚类分析 [J].

刘月光 ;

滕永勇 ;

潘辰 ;

韩延闯 ;

周明全 ;

胡中立 .

氨基酸和生物资源, 2006, (01) :29-32

[2] 用SRAP标记分析中国甘蓝型油菜品种的遗传多样性和遗传基础 [J].

文雁成 ;

王汉中 ;

沈金雄 ;

刘贵华 ;

张书芬 .

中国农业科学, 2006, (02) :246-256

[3] 甘薯SRAP连锁图构建淀粉含量QTL检测 [J].

吴洁 ;

谭文芳 ;

何俊蓉 ;

蒲志刚 ;

王大一 ;

张正圣 ;

詹付凤 ;

阎文昭 .

分子植物育种, 2005, (06) :89-93

[4] 西瓜杂交种遗传多态性的SRAP标记分析 [J].

李严 ;

张春庆 .

园艺学报, 2005, (04) :643-647

[5] 改良CTAB法用于多年生植物组织基因组DNA的大量提取 [J].

陈昆松 ;

李方 ;

徐昌杰 ;

张上隆 ;

傅承新 .

遗传, 2004, (04) :529-531

[6] 新型标记SRAP在棉花F2分离群体及遗传多样性评价中的适用性分析 [J].

林忠旭 ;

张献龙 ;

聂以春 .

遗传学报, 2004, (06) :622-626

[7] Genetic diversity of some accessions of Cucurbita maxima from Spain using RAPD and SBAP markers [J].

Ferriol, M ;

Picó, MB ;

Nuez, F .

GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2003, 50 (03) :227-238

[8]

Sequence-related amplified polymorphism （SRAP）, a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica[J] . G. Li,C. F. Quiros.TAG Theoretical and Applied Genetics . 2001 (2-3)

← 1 →