探讨rDNA ITS区作为果蝇Drosophila nasuta分子系统发育研究的价值

被引：5

作者：

俞海菁

林飞栈

张亚平

朱定良

庚镇城

机构：

[1] 中国科学院昆明动物研究所细胞及分子进化开放实验室!昆明,上海复旦大学遗传研究所上海,台湾中央研究院动物研究所!中国台湾台北市,中国科学院昆明动物研究所细胞及分子进化开放实验室!昆明

[2] ,上海复旦大学遗传研究所!上海,上海复旦大学遗传研究所!上海

来源：

遗传学报 | 2000年 / 01期

关键词：

果蝇nasuta亚群; 核糖体; DNA; 转录间隔区; 系统发育树; RNA二级结构;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q953 [动物遗传学];

学科分类号：

071007 ; 090501 ;

摘要：

测定了果蝇ｎａｓｕｔａ亚群７个分类元和外群Ｄ．ｉｍｍｉｇｒａｎｓ的核糖体基因转录间隔区（ＩＴＳ，ｉｎｔｅｒｔｒａｎｓｃｒｉｂｅｄｓｐａｃｅｒ），包含５．８ＳｒＤＮＡ和２ＳｒＤＮＡ长约１．１ｋｂ的ＤＮＡ片段序列。结果表明：Ｄ．ｐａｌｌｉｄｉｆｒｏｎｓ、Ｔａｘｏｎ　ＬＴｕｏｎ　Ｊ享有共同的序列；Ｄ．ａｌｂｏｍｉｃａｎｓ则与Ｄ．ｓ．ｎｅｏｎａｓｕｔａ共享１个序列。序列之间存在少量的插入缺失和碱基替代。其中插入和缺失主要发生内外群之间，内群中只有Ｄ．ｎｉｖｅｉｆｒｏｎｓ发生１个碱基的插入和１２个碱基的缺失以及Ｄ．ｓ．ｓｕｌｆｕｒｉｇａｓｔｅｒ序列中１个碱基的缺失；而在包括外群在内的碱基替代中，共有５５次转换，６５次颠换，转换／颠换值与动物线粒体基因组十分不同。采用简约法和邻接法构建这７个分类元的系统发育关系。发现Ｄ．ｎｉｖｅｉｆｒｏｎｓ位于树的基部，与其他物种有较远的亲缘关系；Ｄ．ａｌｂｏｍｉｃａｎｓ、Ｄ．ｓ．ｎｅｏｎａｓｕｔａ、Ｄ．ｐａｌｌｉｄｉｆｒｏｎｓｓ、Ｔａｘｏｎ　Ｉ、ＴａｘｏｎＪ最接近，它们是亲缘关系最近的种类。讨论了Ｄ．ｓ．ｓｕｌｆｕｒｉｇａｓｔｅｒ和Ｄ．ｓ．ｎｅｏｎａｓｕｔａ相互接

引用

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页数：8

共 5 条

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张亚平
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