面向“探索脑科学”的连接组计算系统(英文)

被引:17
作者
徐婷 [1 ,2 ,3 ]
杨志 [1 ,2 ,3 ]
姜黎黎 [1 ,2 ,3 ]
邢秀侠 [4 ]
左西年 [1 ,2 ,3 ,5 ]
机构
[1] Key Laboratory of Behavioral Science, Institute of Psychology,Chinese Academy of Sciences
[2] Magnetic Resonance Imaging Research Center, Institute ofPsychology, Chinese Academy of Sciences
[3] Laboratory for Functional Connectome and Development,Institute of Psychology, Chinese Academy of Sciences
[4] Department of Applied and Computational Mathematics,College of Applied Sciences, Beijing University of Technology
[5] Faculty of Psychology, Southwest University
关键词
Connectome; Life span; Big data; Normative charts; Discovery science;
D O I
暂无
中图分类号
Q42 [神经生理学];
学科分类号
071006 ;
摘要
与基因组学非常相似,脑连接组学迅速成为世界大多数国家脑计划的核心组成.除了这些脑计划雄心勃勃的目标,挖掘如此巨大的神经影像数据的一个最基本挑战是如何开发高效、稳健、可靠和易用计算流水线.本文引入一个计算流水线——连接组计算系统(CCS)——来开展基于多模态功能磁共振成像技术的宏观尺度人脑连接组"探索科学".CCS具备3层等级结构:(1)数据清理和预处理,(2)个体连接组绘制和(3)连接组挖掘和知识发现.若干功能模块嵌入到此等级架构,用来实现质量控制、可靠性分析和连接组可视化等功能.基于一个公开的毕生发展样本(6~85岁),我们展示了CCS的具体应用:绘制七大脑功能网络皮层厚度和表面积的毕生发展变化轨线.CCS已经通过GITHUB(https://github.com/zuoxinian/CCS)和我们实验室网站(http://lfcd.psych.ac.cn/ccs.html)向公众免费公开,用于加快人脑连接组学领域的发现科学进程.
引用
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共 1 条
[1]  
Rich-cluborganizationofthehumanconnectome.2M.P.vandenHeuvel,O.Sporns.JNeurosci.2011