加工番茄核心种质构建及其遗传背景分析

被引:23
作者
邓学斌
刘磊
闫喆
李涛
刘希艳
冯晶晶
池海娟
郑峥
李君明
机构
[1] 中国农业科学院蔬菜花卉研究所
关键词
加工番茄; SNP标记; 核心种质; 遗传背景;
D O I
10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0134
中图分类号
S641.2 [番茄(西红柿)];
学科分类号
摘要
基于50年来收集的3 026份加工番茄不同类型种质资源,分别利用20个表型性状和均匀覆盖12条染色体的46个SNP标记,采用5种不同方法(Mstrat、Random、REMC、SBS和SFS)构建了10种初始核心种质。通过对其代表性评价与分析,最终确定了加工番茄最佳核心种质。Mstrat是构建加工番茄亚群核心种质的最佳方法,采用10%抽样比例所构建的302份最佳核心种质GCC1对原始种质的遗传结构和多样性均具有较好的代表性。通过对原始种质群体结构和主成分分析,加工番茄种质资源可分为2个较大的群体,遗传背景分别是基于代表性材料普通栽培番茄E6203和M82,所构建的GCC1核心种质均匀分布在原始种质资源群体。
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