药用植物内生芽孢杆菌的多样性和系统发育研究

被引：10

作者：

陈兰 ^{[1
]}

张小平 ^{[1
]}

Kristina Lindstrom ^{[2
]}

机构：

[1] 四川农业大学资源环境学院

[2] Department of Applied Chemistry and Microbiology,University of Helsinki,Helsinki ,Finland

来源：

微生物学报 | 2008年 / 04期

基金：

高等学校博士学科点专项科研基金;

关键词：

芽孢杆菌; 多样性; 数值分类; 16S DNA PCR-RFLP; BOX-PCR指纹图谱; 系统发育;

D O I：

10.13343/j.cnki.wsxb.2008.04.002

中图分类号：

Q93 [微生物学];

学科分类号：

071005 ; 100705 ;

摘要：

【目的】了解药用植物内生芽孢杆菌的生物多样性。【方法】采用数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、BOX-PCR指纹图谱和16S rDNA序列分析技术对分离于几种药用植物的内生芽孢杆菌和已知参比菌株进行表型、遗传多样性及系统发育研究。【结果】供试菌株在数值分类聚类分析中在84%的相似水平上产生13个表观群。16S rDNA PCR-RFLP分析表明供试菌株表现出丰富的遗传多样性。BOX-PCR指纹图谱分析进一步证明药用植物的内生芽孢杆菌的基因组也具有多样性,聚群的结果与数值分类有较好一致性。用软件在Genbank中进行所得序列的同源性检索,并构建系统发育树。由16S rDNA序列分析可知,供试的代表菌株SCAU11与球形芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)亲缘关系最近,SCAU78和SCAU25为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)的两个亚种,代表菌株SCAU39与巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)的亲缘关系最近。【结论】研究结果表明药用植物内生芽孢杆菌具有明显的表型和遗传多样性。

引用

页码：432 / 438

页数：7

共 8 条

[1] 我国药用植物遗传多样性研究进展 [J].

葛淑俊 ;

孟义江 ;

李广敏 ;

马峙英 .

中草药, 2006, (10) :1584-1589

[2] 内生细菌B菌株的鉴定及其对番茄青枯病的防效测定 [J].

黎起秦 ;

叶云峰 ;

蒙显英 ;

彭好文 ;

林纬 ;

罗宽 .

中国生物防治, 2005, (03) :178-182

[3] 辣椒内生细菌的分离及拮抗菌的筛选 [J].

何红 ;

蔡学清 ;

洪永聪 ;

关雄 ;

胡方平 .

中国生物防治, 2002, (04) :171-175

[4]

常见细菌系统鉴定手册[M]. 科学出版社 , 东秀珠,蔡妙英等编著, 2001

[5]

Diverse rhizobia associated with woody legumes Wisteria sinensis , Cercis racemosa and Amorpha fruticosa grown in the temperate zone of China[J] . Jie Liu,En Tao Wang,Wen Xin Chen.Systematic and Applied Microbiology . 2005 (5)

[6] Taxonomic characterization and plant colonizing abilities of some bacteria related to Bacillus amyloliquefaciens and Bacillus subtilis [J].

Reva, ON ;

Dixelius, C ;

Meijer, J ;

Priest, FG .

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 2004, 48 (02) :249-259

[7]

Genetic diversity of rhizobia isolated from Astragalus adsurgens growing in different geographical regions of China[J] . Journal of Biotechnology . 2001 (2)

[8]

Phylogeny and Diversity of Bradyrhizobium Strains Isolated from the Root Nodules of Peanut （Arachis hypogaea） in Sichuan, China[J] . Systematic and Applied Microbiology . 1999 (3)

← 1 →