以基因突变结合动力学分析的方法研究了水蛭素空间结构及其与凝血酶的相互作用.采用基因定点突变和随机突变的方法得到两个重组水蛭素突变体,并从抗酰胺水解活性,抗凝血酶活力和稳定性三个方面,比较研究了重组水蛭素rHV2中47位和11位两个氨基酸残基对其稳定性和抑制能力的影响.将rHV2中Gln11和Asn47分别突变为His11和Lys47后,rHV2-H11生物活力降低30%,rHV2-K47生物活力提高61%.测定抑制常数Ki表明,rHV2-H11突变体Ki值升高14倍,rHV2-K47突变体Ki值降低14倍,两个突变体的热稳定性均有所增强,rHV2-H11在酸性和碱性条件的稳定性降低.分析实验结果,可以认为:①47位的Lys可能是通过氢键和静电两种作用力同时影响着水蛭素的三维结构和其与凝血酶的结合.②11位氨基酸可能是水蛭素分子中另一个重要位点.