水稻冷胁迫诱导的甲基化差异片段CIDM7的分离和分析

被引:131
作者
华扬
陈学峰
熊建华
张义平
朱英国
机构
[1] 武汉大学植物发育生物学教育部重点实验室,武汉大学植物发育生物学教育部重点实验室,武汉大学植物发育生物学教育部重点实验室,武汉大学植物发育生物学教育部重点实验室,武汉大学植物发育生物学教育部重点实验室武汉,武汉,武汉,武汉,武汉
关键词
胞嘧啶甲基化; 水稻; AFLP; 冷胁迫;
D O I
10.16288/j.yczz.2005.04.019
中图分类号
S511 [稻];
学科分类号
090104 [作物信息科学与技术];
摘要
采用基于AFLP的甲基化敏感扩增多态性的方法对5℃冷处理48h的水稻9311叶片DNA胞嘧啶甲基化模式进行了初步研究,发现冷处理48h后9311基因组中一些CCGG位点发生了重新甲基化或去甲基化,并获得一些与水稻cDNA高度同源的甲基化差异片段,其中CIDM7(coldinducingdifferentialmethylation)片段在冷胁迫后去甲基化。Northern杂交证明CIDM7在冷胁迫后增强表达。通过在日本晴全长cDNA数据库中的同源搜索获得其全长cDNA序列,该cDNA序列全长1422bp,编码425个氨基酸,经氨基酸序列分析为一个具有Fbox结构的假定蛋白。CIDM7为单拷贝,定位于日本晴10号染色体12.56~12.57Mb。
引用
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