草菇培养料中微生物总DNA的高效提取

被引:5
作者
侯立娟
李玉
孟丽
John A.Buswell
陈明杰
宋金俤
机构
[1] 吉林农业大学
[2] 上海市农业科学院食用菌研究所
[3] 江苏省农业科学院蔬菜研究所
关键词
草菇培养料; DNA; 微生物; PCR扩增;
D O I
10.13759/j.cnki.dlxb.2011.11.026
中图分类号
S646.13 [];
学科分类号
摘要
比较了化学裂解与酶裂解相结合法、氯化苄法、CTAB法、改良CTAB法、MP土壤试剂盒法和植物试剂盒法6种提取草菇培养料总DNA的方法。结果表明:不同方法的A260/A280比值有较大差异,其中化学裂解与酶裂解相结合法提取DNA的产量最高,而新型植物基因组DNA提取试剂盒提取培养料DNA的产量最低,分别为(2 372.72±28.85)μg/g和(87.67±2.04)μg/g。采用真菌、细菌及放线菌特异性引物进行PCR扩增,结果表明,除氯化苄法没有扩增出目的条带外,其余方法均能扩增出目的条带,说明其均能从草菇培养料中同时有效地提取真菌、细菌和放线菌总DNA。综合评价了各方法的DNA产量、纯度、PCR扩增效果、试验时间、费用成本5个指标,其中采用化学裂解与酶裂解相结合法提取出的DNA产量最高,但所用时间较长;MP土壤试剂盒提取的DNA纯度最高、所需时间较短,但成本较高。
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