谷子肌动蛋白基因的克隆及序列分析

被引:32
作者
李园莉
江元清
赵武玲
阎隆飞
机构
[1] 中国农业大学生物学院,植物生理学与生物化学国家重点实验室,中国农业大学生物学院,植物生理学与生物化学国家重点实验室,中国农业大学生物学院,植物生理学与生物化学国家重点实验室,中国农业大学生物学院,植物生理学与生物化学国家重点实验室北京,北京,北京,北京
关键词
谷子; 肌动蛋白基因; 快速扩增cDNA末端; 分子进化;
D O I
暂无
中图分类号
Q946 [植物生物化学];
学科分类号
071001 [植物学];
摘要
以谷子 (Setariaitalica)为材料 ,提取总RNA。根据植物肌动蛋白基因编码区的两端的保守序列设计了简并引物 ,用 5’RACE方法扩增出了谷子肌动蛋白基因编码区序列。以豌豆肌动蛋白cDNA作探针进行的Southern杂交分析表明扩增出了目的基因。将所获得的片段克隆到T载体后进行测序 ,序列分析结果表明 :谷子肌动蛋白基因的编码区长 1 1 3 1个核苷酸 ,编码了 3 77个氨基酸 ;所得序列 (命名为MIAc)与GenBank中注册的肌动蛋白基因序列的相似性均在 6 0 %以上 ,与其它肌动蛋白氨基酸序列的相似性达 89%以上。根据高等植物肌动蛋白序列相似性重建了进化树 ,表明谷子肌动蛋白与水稻肌动蛋白异型体RAc2和RAc3之间的亲缘关系最为密切 ,在进化过程中分化时间最为接近
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