南极菲尔德斯半岛表层土壤样品中细菌多样性的系统发育分析

被引：5

作者：

李会荣 ^{[1
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孙嘉康 ^{[1
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陈丽珊 ^{[1
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俞勇 ^{[2
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陈波 ^{[2
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任大明 ^{[1
]}

机构：

[1] 复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室

[2] 中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室

来源：

极地研究 | 2005年 / 04期

关键词：

南极; 表层土壤; 细菌; DGGE; 16S rDNA;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q931 [微生物的演化（适应与变异）];

学科分类号：

摘要：

通过PCR结合变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对从南极长城站附近表层土壤样品中获得16SrDNA序列特征片段V3区序列进行分离。对其中的主要12条DGGE条带进行胶回收,获得的DNA片段经测序以及计算机比对分析发现,它们分别属于β、γ、δ-变形细菌(Proteobac-teria)、噬纤维菌-屈挠杆菌-拟杆菌(Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides,CFB)群细菌、放线细菌(Actinobacteria)、蓝细菌属(Cyanobacteria)、酸杆菌属(Acidobacteria)和绿屈挠菌属(Chlo-roflexi)等系统分类群。南极表层土壤样品中的大部分16S rDNA序列与从其他土壤或沉积物样品中直接获得的序列相似性较高(93%—100%)。

引用

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