病原菌诱导转录的水稻Rim2家族转座酶编码亚组的结构与分布

被引：2

作者：

田平芳

王国栋

吴刚

李群

罗利军

李德葆

何祖华

机构：

[1] 浙江大学生物技术研究所,中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,上海市农业生物基因中心,浙江大学生物技术研究所,浙江大学生物技术研究所杭州中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,上海,上海华东师范大学生物系,上海,上海,上海,上海,

来源：

植物生理与分子生物学学报 | 2003年 / 03期

关键词：

水稻; Rim2因子; 转座酶编码亚组; 分子结构; 分布;

D O I：

暂无

中图分类号：

S511 [稻];

学科分类号：

摘要：

以基因组克隆Rim2 5 6 9为代表 ,分析了该家族中转座酶编码亚组的分子结构 ,同时对Rim2因子在染色体和不同水稻品种之间的差别分布情况进行了研究。序列分析表明 ,Rim2 5 6 9具有完整的 16 bp的末端颠倒重复序列 (TIRs)、若干正向和反向的 16 bp的亚末端重复 (STRs)以及插入位点 3 bp的同向重复。它的TIRs上具有保守序列CACTG ,有别于以往报告的CACTA转座子。该因子含有一个编码区 ,与已报告的Rim2cDNA的ORF基本一致 ,其预测编码蛋白与CAC TA转座子编码的转座酶TNP2和TNPD有低度的同源性。该亚组的其它因子的分子结构均与Rim2 5 6 9的相似 ,但这些因子预测ORF长度上存在着差异 ,反映了结构上的多样性。对检索到的Rim2因子的定位作图表明 ,它们在已测序拼接完成的第 1、4和 10号染色体上呈不均匀分布 ,以着丝点附近的分布频率为最高。PCR反应显示 ,Rim2编码因子在品种之间存在着编码序列多态性。

引用

页码：257 / 264

页数：8

共 2 条

[1]

The rice Rim2 transcript accumulates in response to Magnaporthe grisea and its predicted protein product shares similarity with TNP2-like proteins encoded by CACTA transposons[J] . Z.-H. He,H.-T. Dong,J.-X. Dong,D.-B. Li,P. C. Ronald.Molecular and General Genetics . 2000 (1-2)

[2]

Identification of Tnr3 , a Suppressor-Mutator/Enhancer -like transposable element from rice[J] . Reiko Motohashi,Eiichi Ohtsubo,Hisako Ohtsubo.MGG Molecular ＆ General Genetics . 1996 (2)

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