黄花烟草K+通道基因NKC1克隆与序列分析

被引:11
作者
郭兆奎 [1 ]
杨谦 [1 ]
颜培强 [2 ]
万秀清 [2 ]
机构
[1] 哈尔滨工业大学生命科学与工程系
[2] 黑龙江省烟草科学研究所
关键词
黄花烟草; 钾通道; 转录; 序列分析;
D O I
暂无
中图分类号
S572.033 [];
学科分类号
0901 ;
摘要
通过已知生物钾通道蛋白保守序列分析,设计兼并引物对钾饥饿处理的烟草幼根总RNA的反转录产物进行PCR扩增,分离到K+通道基因NKC1,该基因的cDNA阅读框由2481个核苷酸组成,编码的蛋白含有826个氨基酸(分子量为94.6KD),等电点为6.60;将核苷酸序列输入NCBI进行BlastX其同源序列大部分为高亲和K+转运体,与该基因同源性最高的是Solanum tuberosum钾通道基因SKT1,其氨基酸同源性为79%,预测该蛋白具有6个跨膜区域,采用同源模建方法预测了NKC蛋白活性区域的3维结构。同时,特异性转录分析发现NKC1基因在烟草幼根、叶片和花各器官均有表达,而以幼根组织中转录量最多;缺钾处理可显著诱导根系中NKC基因的转录,而高浓度NH4+处理对该基因的转录具有抑制作用,证实NKC基因在黄花烟草的钾吸收过程中起着重要作用。
引用
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