小麦TaPK7基因单核苷酸多态性与抗旱性的关系

被引:52
作者
张洪映 [1 ]
毛新国 [1 ]
景蕊莲 [1 ]
谢惠民 [2 ]
昌小平 [1 ]
机构
[1] 中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程/农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室
[2] 西北农林科技大学农学院
基金
国家高技术研究发展计划(863计划);
关键词
小麦; TaPK7基因; 单核苷酸多态性; 抗旱性; 单倍型;
D O I
暂无
中图分类号
S512.1 [小麦];
学科分类号
090302 [植物营养学];
摘要
以抗旱性不同的45份六倍体小麦和5份小麦的二倍体近缘种为材料,通过测序检测TaPK7基因的单核苷酸多态性,研究了TaPK7基因多态性与抗旱性的关系,旨在为发掘利用小麦抗旱基因资源奠定基础。50份材料TaPK7序列总长220448bp,其中有64个SNP和9个InDel,二者的频率分别为1SNP/3445bp和1InDel/24494bp。编码区的核苷酸多样性π值小于非编码区,可能是由于编码区承受的选择压力较大。同义突变(Ka)与非同义突变(Ks)比值是0.415,表明该基因受负向选择影响,属于相对保守基因。在编码区检测到16个单核苷酸突变,多存在于抗旱材料中。共检测到21种单倍型,其中5种为强抗旱材料单倍型,2种为干旱极敏感材料单倍型,11种中等抗旱材料单倍型,另外3种单倍型中同时包括抗旱材料和干旱敏感材料,初步揭示了TaPK7基因的单核苷酸多态性与抗旱性相关。
引用
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