SSR荧光标记和银染技术的比较分析

被引:134
作者
郝晨阳
王兰芬
贾继增
董玉琛
张学勇
机构
[1] 中国农业科学院作物品种资源研究所
关键词
小麦; 微卫星; 荧光PCR; 基因组扫描;
D O I
暂无
中图分类号
S512.1 [小麦];
学科分类号
摘要
应用多重PCR简单重复序列 (SSR)荧光标记分析技术和常规的SSR银染技术 ,对北方冬麦区 4 5 1份材料 (中国小麦初选核心种质的一部分 )进行分析 ,用相同材料和引物 ,对这两种方法的检测效果进行评价。用 2 4对引物扩增 ,银染法共检测出 2 35个等位变异 ,每个位点检测到的等位变异为 3~ 2 0 ,平均为 9 8个 ,多态性信息指数PIC为 0 2 2~ 0 93,平均 0 74 ;而荧光标记可检测到 312个等位变异 ,每个位点检测到的等位变异为 4~ 2 4 ,平均为 13 0个 ,PIC为 0 32~0 97,平均 0 75。荧光技术较银染方法在每个位点上多检测到 3个等位变异 ,检测效果更为理想 ,更适于进行遗传多样性分析和研究 ;对两种方法的费用和工作效率做了初步分析 ,表明完成 5 0 0 0× 78个反应在费用基本持平的情况下 ,微卫星荧光标记技术的检测效率显著高于银染法 (7 8倍 )。同时对微卫星荧光标记技术中低成本、高通量多重PCR体系的建立及Genescan 3 7、Genotyper 3 7软件数据分析中出现的一些具体问题进行了探讨。
引用
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共 5 条
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