以湖南和湖北大豆[Glycine max(L.)Merr.]为例分析影响遗传多样性评价的因素

被引：10

作者：

关媛 ^{[1
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鄂文弟 ^{[1
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王丽侠 ^{[1
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关荣霞 ^{[1
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刘章雄 ^{[1
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常汝镇 ^{[1
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曲延英 ^{[2
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邱丽娟 ^{[1
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机构：

[1] 中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程/农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室

[2] 新疆农业大学

来源：

作物学报 | 2007年 / 03期

基金：

国家科技攻关计划;

关键词：

大豆; 遗传多样性; SSR标记; Shannon指数; 期望杂合度; 等位变异数; 取样量;

D O I：

暂无

中图分类号：

S565.1 [大豆];

学科分类号：

0901 ;

摘要：

以不同来源大豆种质为材料进行基因组SSR分析,探讨大豆遗传多样性研究方法,旨在为科学评价大豆种质资源提供参考。当取样比例相同时,湖北大豆的遗传丰富度显著高于湖南大豆,但两省大豆遗传多样性指数之间没有显著差异。当取样量相同时,利用随机取样法比较,湖南大豆的遗传多样性显著高于湖北,而利用聚类取样比较,两省大豆的遗传多样性没有显著差异。在遗传多样性指数相同情况下,湖北大豆的遗传丰富度显著高于湖南大豆。取样数与三个遗传多样性评价参数(等位变异数、Shannon指数、He)之间均达到显著和极显著相关。以湖南大豆为例,估算出在大豆SSR遗传多样性分析中,至少需要50-60个样本,即占总体9.0%-10.8%的取样比例,才能代表总体的遗传变异。提出在评价大豆遗传多样性时,应用大豆样本数对其遗传多样性指数计算公式进行修正,建议将Shannon指数计算公式改为H=-lnN∑PilnPi(N为样本数)。根据修正公式分析,结果表明,湖北大豆的遗传多样性高于湖南大豆。

引用

页码：461 / 468

页数：8

共 11 条

[1] 种群微卫星DNA分析中样本量对各种遗传多样性度量指标的影响 [J].