共 1 条
[1]
医学分子病毒学.[M].金奇主编;.科学出版社.2001,
肠道病毒ECHO13中国分离株的基因特征
被引：22
作者：
毛乃颖
许文波
杨秀惠
刘中华
严延生
潘伟毅
张勇
机构：
[1] 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,福建省疾病预防控制中心,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,福建省疾病预防控制中心,福建省疾病预防控制中心,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 北京 , 北京 ,福州 福建医科大学 福州 ,北京 西安交通大学医学院 西安 , 福州 福建医科大学 福州 , 福州 , 北京
来源：
关键词：
人类肠道病毒(HEV);
ECHO13病毒;
VP1基因;
基因型;
D O I：
10.13242/j.cnki.bingduxuebao.001650
中图分类号：
R373.24 [];
学科分类号：
100103 ;
100705 ;
摘要：
为研究ECHO13病毒中国分离株的分子特征及其与世界其它分离株之间的基因关系,对1998年、2000年从中国福建省分离到2株ECHO13病毒进行基因序列对比分析。2株病毒分别命名为Fujian98-1和Fujian00-1,用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出VP1蛋白编码基因全长861个核苷酸片段并进行序列测定,将2株E CHO13病毒的VP1序列与所有已发表的ECHO13病毒VP1基因全长进行同源性比较。结果显示,福建分离株之间核苷酸同源性为79 6%,氨基酸同源性为93 4%;与遗传距离最近的法国CF1089-91(AJ537604)毒株的核苷酸同源性分别为80%和88%,与代表株DelCarmen的核苷酸同源性分别为75 8%和77 9%。通过VP1基因分析,福建2株病毒均属于ECHO13病毒,与血清中和试验鉴定结果一致。下载所有已发表的ECHO13病毒VP1序列并构建进化树,发现福建2株病毒分属不同的分枝,提示这2株病毒来自不同的病毒传播链。进一步分析发现,整个E CHO13病毒可划分为3个不同的基因型:A、B和C基因型。福建Fujian98-1和Fujian00-1分别被划分在基因型B和C中,各基因型之间的核苷酸差异均大于20%。为验证该分型方法,将26株来自不同国家和时间的ECHO13病毒和2株福建分离ECHO13病毒部分VP1基因序列进行对比分析,建立进化树。结果显示,所有ECHO13病毒被分在A、B和C3个基因
引用
收藏
页码：308 / 314
页数：7
相关论文