16S～23SrDNA内转录间隔区序列分析及其在分支杆菌鉴定中的应用价值

被引：28

作者：

李国利

庄玉辉

赵铭

王国治

范以虎

陈保文

胡忠义

机构：

[1] 解放军第三○九医院结核病研究室,解放军第三○九医院结核病研究室,解放军第三○九医院结核病研究室,中国药品生物制品检定所,解放军第三○九医院结核病研究室,中国药品生物制品检定所,上海市疾病预防控制中心北京,北京,北京,北京

来源：

中华结核和呼吸杂志 | 2002年 / 03期

关键词：

分支杆菌; 鉴定; 内转录间隔区; 聚合酶链反应; 序列分;

D O I：

暂无

中图分类号：

R446.5 [微生物学检验];

学科分类号：

100208 ;

摘要：

目的　研究 16S～ 2 3SrDNA内转录间隔区 (internaltranscribedspacer,ITS)序列在分支杆菌鉴定中的应用价值。方法　应用PCR 直接测序法对 2 2种 30株分支杆菌参考菌株和 16株分支杆菌临床分离菌株 16S～ 2 3SrDNAITS测序。对所测定序列以及GenBank所报道的有关序列用Clustal程序 (MegAlignPackage [WindowsVersion 4 0 1];DNASTAR ,Madson ,Wis)处理分析 ,计算种间相似性 ,用PHYLIPPackage构建分支杆菌菌种聚类分析树状谱。结果　除结核分支杆菌复合群 (MTC)菌种 (结核分支杆菌、牛分支杆菌、非洲分支杆菌和田鼠分支杆菌 ) 16S～ 2 3SrDNAITS序列完全一致外 ,其它分支杆菌菌种间核苷酸排列顺序及长度变异较大 ,种间相似性为 30 4 %～ 86 5 % ,聚类分析树状谱能将各分支杆菌菌种相分离。结果表明 16S～ 2 3SrDNAITS序列分析能将MTC与非结核分支杆菌 (NTM)相鉴别 ,能将NTM鉴定至种的水平。结论　 16S～ 2 3SrDNAITS可做为分支杆菌鉴定的靶基因。

引用

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