适用于玉米DNA指纹库构建的SSR核心引物的重新设计与优化

被引：6

作者：

于新艳 ^{[1
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王凤格 ^{[2
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赵久然 ^{[2
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王玺 ^{[1
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易红梅 ^{[2
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王璐 ^{[2
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郭景伦 ^{[2
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匡猛 ^{[2
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孙艳美 ^{[2
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机构：

[1] 沈阳农业大学农学院

[2] 北京市农林科学院玉米研究中心

来源：

分子植物育种 | 2007年 / 03期

基金：

北京市自然科学基金;

关键词：

玉米; SSR; 核心引物; 引物设计;

D O I：

暂无

中图分类号：

S513 [玉米（玉蜀黍）];

学科分类号：

0901 ;

摘要：

为了确定出适用于玉米DNA指纹库构建的引物,对部分并不是完全符合玉米DNA指纹库构建引物筛选原则的引物进行重新设计与优化,使其基本符合核心引物设计的要求。以umc2105、umc1705和phi299852为例,下载原引物的基因组序列,利用两个常用的引物设计软件Primer Premier5.0和Oligo6.57进行引物的重新设计及评估,在Tm值、GC含量、引发效率、错误引发率、3'端G值、引物二聚体等方面对引物进行改善,结果表明,经过对原引物的重新设计和优化,新设计的引物均能清晰的扩增,扩增效果得到了明显的改善,并且均能在统一的条件下进行实验,符合了玉米DNA指纹库构建的要求。

引用

页码：443 / 447

页数：5

共 7 条

[1] 牛CD18编码全基因特异引物设计与PCR扩增 [J].