大肠杆菌MG1655菌株ERIC-PCR图谱主带序列组成分析

被引:24
作者
陈迎春
曹又方
赵立平
机构
[1] 上海交通大学生命科学技术学院生物工程系
[2] 山西大学生物工程实验室
[3] 上海交通大学生命科学技术学院生物工程系 上海
[4] 太原
[5] 上海
关键词
RIC序列; ERIC-PCR; EcoliK-12 MG1655菌株;
D O I
10.13344/j.microbiol.china.2002.06.008
中图分类号
Q933 [微生物遗传学];
学科分类号
071007 ;
摘要
ERIC PCR已经在细菌分类、鉴定及混合菌群分析中得到广泛应用 ,但对其产物形成规律的认识仍存在分歧。以大肠杆菌MG1 655为对象 ,对其ERIC PCR指纹图谱中 1 1kb主带中的DNA片段进行了克隆、测序、基因组定位以及引物匹配分析。结果表明 ,这条1 1kb主带由分布在基因组中不同位置的 3种序列不同的片段组成 ,各片段的丰度差异较大 ,最高为 97 89% ;3种片段中的 2种所在的基因组区域仅一端含有ERIC序列。推测对含有ERIC序列的基因组DNA进行扩增时 ,ERIC PCR是一种非随机扩增。
引用
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共 3 条
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