结肠正常黏膜和腺癌中差异表达基因的生物信息学分析

目的 :系统地分析由 SSH方法获得的结肠正常黏膜和腺癌的差异表达基因。方法 :构建基于 L inux的核酸自动分析平台 ,对用 SSH方法获得的 3个文库之一的 T- N差减文库进行分析。用半定量 RT- PCR对部分结果进行验证。结果 :成功构建了基于 Linux的核酸自动分析平台 ,得到了 15个 contigs,其中与已知基因相匹配的有 13个(T- N) ,未与已知基因匹配或者意义未明的有 2个 ;部分基因的半定量 RT- PCR发现 ,人胸腺素 β4 (H omo Sapiensthymosin beta4 ,THY)和人乙型肝炎病毒 x抗原反式活化蛋白 2 (H omo Sapiens H bx Ag transactivated protein2 ,XTP)的表达从正常黏膜 -腺癌有逐步增高的趋势。结论 :构建基于 L inux的核酸自动分析平台是系统分析核酸序列的有效方法 ,根据对 3个文库的系统分析结果 ,为进一步阐明结肠肿瘤分子机制提供了许多有价值的信息。