基因预测方法的研究进展

被引：22

作者：

张恩民

海荣

俞东征

机构：

[1] 传染病预防控制国家重点实验室,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所人兽共患病室

来源：

中国媒介生物学及控制杂志 | 2009年 / 20卷 / 03期

关键词：

基因预测; 剪接联配; 开放读码框; 马尔可夫模型;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q75 [分子遗传学];

学科分类号：

071007 [遗传学];

摘要：

基因预测一般指预测DNA序列中编码蛋白质的部分。其方法主要有两大类:一类是基于相似性的预测方法,即利用已知的mRNA或蛋白质序列为线索在DNA序列中搜寻所对应的片段,达到基因预测的目的;另一类是基于统计学模型的从头预测方法,即利用统计学模型训练出相应参数,再对基因进行预测,这种方法可不依赖已知的DNA序列进行预测。现就基因预测的方法、基因预测中存在的一些问题等做一概述。

引用

页码：271 / 273

页数：3

共 3 条

[1]

Test data sets and evaluation of gene prediction programs on the rice genome [J].

Li, H ;

Liu, JS ;

Xu, Z ;

Jin, J ;

Fang, L ;

Gao, L ;

Li, YD ;

Xing, ZX ;

Gao, SG ;

Liu, T ;

Li, HH ;

Li, Y ;

Fang, LJ ;

Xie, HM ;

Zheng, WM ;

Hao, BL .

JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2005, 20 (04) :446-453

[2]

IDENTIFICATION OF PROTEIN-CODING REGIONS IN GENOMIC DNA [J].

SNYDER, EE ;

STORMO, GD .

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 1995, 248 (01) :1-18

[3]

常用生物数据分析软件.[M].王俊; 丛丽娟; 郑洪坤; 著.科学出版社.2008,

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