不同性别类型黄瓜ACC合酶基因的单核苷酸多态性标记和酶切扩增长度多态性标记

被引：12

作者：

向太和

王利琳

庞基良

胡江琴

申屠连峰

吴锴

机构：

[1] 杭州师范学院生命科学学院

来源：

生物化学与生物物理进展 | 2006年 / 04期

基金：

浙江省自然科学基金;

关键词：

黄瓜; 性别类型; 1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)合酶基因; 单核苷酸多态性(SNP); 酶切扩增长度多态性(CAPS);

D O I：

暂无

中图分类号：

S642.2 [黄瓜]; Q943.2 [植物基因工程];

学科分类号：

090202 ; 071007 ; 090102 ;

摘要：

黄瓜的性别分化与乙烯密切相关,1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)合酶是乙烯生物合成过程中的关键酶.根据ACC合酶基因家族的保守序列设计PCR引物,从8个不同性别类型(雌雄同株、强雌性和全雌性)黄瓜品种中克隆了长度为1188bp的ACC合酶基因(CS-ACS2)片段(GenBank登记号为:DQ115884～DQ115886和DQ115875～DQ115879).经测序分析,3个雌雄同株性别类型品种的序列完全相同.与之相比,5个强雌性和全雌性品种中存在8个单核苷酸多态性(SNPs)标记,SNPs标记为4个A←→G和4个T←→C之间的转换.在8个SNPs中,有1个SNP位于内含子区域,其余7个SNPs都位于外显子区域.在7个位于外显子区域的SNPs中,有3个为非编码区的SNPs,4个为cSNPs.而在4个cSNPs中,有3个导致了编码的氨基酸序列改变.研究结果表明,与雌雄同株性别类型相比,雌性系中均存在单核苷酸的变异,这提示ACC合酶基因CS-ACS2的单核苷酸变异可能与黄瓜雌性系的发生形成有关.另一方面,根据SNP多态性还发展了一个酶切扩增长度多态性(CAPS)标记C-MT700.利用CAPS标记C-MT700能将强雌性优良品种MT-705与其他黄瓜品种相区别,该标记在黄瓜育种生产上具有一定的应用价值.此外,研究获得的SNPs标记和CAPS标记丰富了黄瓜的分子标记种类.

引用

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页数：6

共 8 条

[1] 不同性别类型黄瓜品种基因组DNA的提取及RAPD标记的初步研究 [J].