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肿瘤转移相关基因cDNA芯片的制备与应用
被引:18
作者:
孙青
丁彦青
高雪芹
闫实
韩金祥
机构:
[1] 第一军医大学病理学教研室,第一军医大学病理学教研室,山东省医学科学院,山东省医学科学院,山东省医学科学院广东广州,广东广州,山东济南,山东济南,山东济南
来源:
关键词:
肿瘤转移;
生物信息学;
基因,肿瘤;
cDNA芯片;
肠肿瘤;
肺癌;
基因表达谱;
D O I:
暂无
中图分类号:
R730.231 [肿瘤病因学、发生学];
学科分类号:
100214 ;
摘要:
目的建立制备肿瘤转移相关基因cDNA基因芯片的方法,并探讨其在肿瘤转移表达谱应用方面的意义。方法选择了399个已知转移相关基因克隆,经PCR扩增纯化后,以Cartesian Pixsys 5500芯片点样仪点布于多聚赖氨酸包被的玻片上;采用Cy3-dUTP和Cy5-dUTP双重荧光标记人大肠癌和肺癌细胞、正常组织、大肠癌和肺癌组织总RNA并与阵列进行杂交。结果经ScanArrayTM 4000共聚焦荧光扫描仪检测,图像背景均匀,信号清晰,效果满意。对大肠癌细胞系和组织标本及肺癌标本表达基因扫描结果行联合聚类分析发现:两种癌的基因表达大多数相同,仅少数有差别,有30种在两种转移癌中呈持续上调或下调的基因,包括运动因子基因、粘附分子、蛋白水解酶、癌基因、抑癌基因、抑制或促进凋亡基因以及诱导血管增生和信号转导的基因等。结论优化的cDNA基因芯片制备技术用于基因表达分析有较高的效率和可靠的实用性能。检测的肿瘤转移相关基因的表达在两种癌无明显差别,表明不同癌其浸润和转移的分子机制大致相同。
引用
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