基于中药数据库的HIV抑制剂的筛选

被引：10

作者：

高维娜 ^{[1
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李云 ^{[1
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张瑞 ^{[1
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高慧 ^{[1
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徐为人 ^{[2
]}

李爱秀 ^{[3
]}

杜奇石 ^{[1
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张欣 ^{[1
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魏冬青 ^{[1
]}

机构：

[1] 天津师范大学生物信息与药物开发研究所

[2] 天津药物研究院

[3] 武警医学院

来源：

药学学报 | 2006年 / 03期

关键词：

蛋白酶抑制剂; 中药分子数据库搜索; 分子对接; 分子动力学; 亚叶酸;

D O I：

暂无

中图分类号：

R285 [中药药理学];

学科分类号：

100806 [中药药理学];

摘要：

目的用现代化学信息学手段和中药化学数据库寻找新的抗H IV药物。方法利用现有的抗H IV的药物作模版,进行中药分子数据库搜索,然后采用分子对接方法得到H IV-1蛋白酶受体与亚叶酸的合理复合物结构,用分子动力学方法对对接结果分别进行无水存在200 ps和有水存在50 ps的模拟。结果根据数据库搜索和对接,认为亚叶酸可以作为药物开发的起点。通过分析分子动力学数据,可以了解配体各个区域与受体相互作用的细节和变化规律。结论本工作得到的H IV-1蛋白酶与中药分子抑制剂的结合模式信息将有助于设计和改造出效果更好的抗H IV-1蛋白酶抑制剂。

引用

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