松属树种种苗鉴定中AFLP指纹技术的研究(英文)

被引:5
作者
李淑娴
陈志银
沈永宝
尹佟明
施季森
机构
[1] 南京林业大学南方林木种子检验中心
[2] 南京林业大学南方林木种子检验中心 江苏 南京 
[3] 江苏 南京 
关键词
种子检验; 扩增片段长度多态性; 松属;
D O I
暂无
中图分类号
S718 [森林生物学];
学科分类号
071012 ; 0713 ;
摘要
AFLP(扩增片段长度多态性)标记技术是高效而可靠的标记技术之一,特别对于那些基因组序列信息很少的物种更为有效。笔者对基因组较大的松属树种的AFLP实验程序进行了优化,提供了松树树种AFLP分析中DNA酶切、引物连接、预扩增及选择性扩增的优化实验程序。结果显示,预扩增反应中利用选择碱基数不同的预扩增引物(E/M+1,E/M+2)制备的模板对后续的选择性扩增结果没有显著影响;在选择性扩增反应中,对碱基数目选择进行了细致的优化,分别测试了15个E+3/M+3引物组合,6个E+4/M+3引物组合及15个E+3/M+4引物组合。对于有相同选择碱基数的引物,扩增结果随选择碱基的组合不同而有较大差异。据总的扩增结果发现,选择碱基增加时,扩增谱带数明显减少,谱带清晰度增加,即当选择碱基增加到E引物末端时(M+4/E+3),大多数引物组合的扩增谱带数要比选择碱基增加到M引物末端(E+3/M+4)的引物组合扩出的谱带数少且带型清晰。总体来看,E+4/M+3的引物组合比较适合于松属树种的AFLP分析。笔者还利用单株树种子的胚乳组织对AFLP标记的遗传方式进行了研究,在所用的两个引物组合获得的标记中,约有30%左右的分离标记,分离标记中偏分离比例约为6%。另外,选用3个松属树种对选出的14个AFLP引物组合进行的验证显示,这些组合在不同种间均获得了
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共 2 条
  • [1] Optimization of AFLP fingerprinting of organisms with a large-sized genome: a study on Alstroemeria spp[J] . T. H. Han,H. J. van Eck,M. J. De Jeu,E. Jacobsen.TAG Theoretical and Applied Genetics . 1999 (3-4)
  • [2] The Studies on cultivars identification and genetics diversity in Chestnut and Gingko by molecualr markers .2 Shen Y B. . 2002