目的探讨莫沙必利与多潘立酮治疗功能性消化不良的临床治疗效果。方法选取我院2015年2月-2016年2月收治的患有功能性消化不良的患者100例,按照就诊顺序分为对照组和观察组,每组各50例。对照组患者服用多潘立酮,观察组患者服用莫沙必利,对比两组患者的临床治疗效果。结果观察组患者的临床治疗总有效率较对照组高,差异有统计学意义(P<0.05);观察组患者不良反应发生率为4.0%,对照组为12.0%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论功能性消化不良患者采用莫沙必利治疗的临床效果显著高于多潘立酮,值得在临床上使用。