辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶基因(BADH)启动子分离及序列分析

被引:17
作者
李秋莉
张毅
尹辉
李丹
机构
[1] 辽宁师范大学生命科学学院
关键词
辽宁碱蓬; 甜菜碱醛脱氢酶; 启动子; 序列分析;
D O I
10.13345/j.cjb.2006.01.012
中图分类号
Q943.2 [植物基因工程];
学科分类号
071007 ; 090102 ;
摘要
根据已知的辽宁碱蓬BADHcDNA5′端序列设计两个基因特异的反向引物(BR1,BR2),通过衔接头PCR获得了BADH基因起始密码子上游265bp的序列。根据所获得的序列设计两个基因特异的反向引物(BR3,BR4),用BR2、BR3、BR4分别与4个简并引物配对,通过TAILPCR扩增,获得了约2kb的序列。经Sequencer软件拼接上述两段序列,获得了BADH基因起始密码子上游2055bp的序列。用TSSPTCM软件分析此序列,预测出转录起始点(T)位于起始密码子上游62bp处,由此获得了1993bp的SlBADH启动子序列。用PLACE软件分析此序列,发现该序列具有启动子的基本元件TATAbox、CAATbox,包含多个胁迫诱导元件,如盐诱导元件GAAAAA,抗冻、缺水、脱落酸、抗寒元件CANNTG,伤害诱导元件ANATTNCNN,热激元件ATAAATGT等,是一个强的胁迫诱导启动子。
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共 1 条
[1]  
Rapid isolation of promoter sequences by TAIL-PCR: the 5′-flanking regions of Pal and Pgi genes from yams (Dioscorea)[J] . R. Terauchi,G. Kahl.MGG - Molecular and General Genetics . 2000 (3)