采用混合方法抽取生物医学实体间语义关系

被引:3
作者
王秀艳 [1 ]
崔雷 [2 ]
机构
[1] 南方医科大学珠江医院图书馆
[2] 中国医科大学信息管理与信息系统(医学)系
关键词
生物医学实体; 语义关系抽取; 自然语言处理;
D O I
暂无
中图分类号
G350 [情报学];
学科分类号
1205 ;
摘要
以阿司匹林副作用为研究样本的主题,搜集PubMed数据库中与"药物副作用引起疾病"主题词关联规则相对应的文献记录,在文献摘要中提取出相应实体共现的句子,进而利用自然语言处理方法提取文献中表达生物医学实体间语义关系的动词,共提取出30个表示药物副作用与疾病关系的动词。研究结果表明:基于共现和自然语言处理提取语义关系动词的方法是可行的。
引用
收藏
页码:77 / 82
页数:6
相关论文
共 7 条
[1]   蛋白质相互作用的文本挖掘研究进展 [J].
张智 ;
张正国 .
中国生物医学工程学报, 2008, (05) :764-772+782
[2]   Extracting Protein Interactions from Text with the Unified AkaneRE Event Extraction System [J].
Saetre, Rune ;
Yoshida, Kazuhiro ;
Miwa, Makoto ;
Matsuzaki, Takuya ;
Kano, Yoshinobu ;
Tsujii, Jun'ichi .
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2010, 7 (03) :442-453
[3]   Using text to build semantic networks for pharmacogenomics [J].
Coulet, Adrien ;
Shah, Nigam H. ;
Garten, Yael ;
Musen, Mark ;
Altman, Russ B. .
JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 2010, 43 (06) :1009-1019
[4]   A concept-driven biomedical knowledge extraction and visualization framework for conceptualization of text corpora [J].
Jahiruddin ;
Abulaish, Muhammad ;
Dey, Lipika .
JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 2010, 43 (06) :1020-1035
[5]   Building Disease-Specific Drug-Protein Connectivity Maps from Molecular Interaction Networks and PubMed Abstracts [J].
Li, Jiao ;
Zhu, Xiaoyan ;
Chen, Jake Yue .
PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2009, 5 (07)
[6]   Getting started in text mining [J].
Cohen, K. Bretonnel ;
Hunter, Lawrence .
PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2008, 4 (01)
[7]  
Extraction of CYP Chemical Interactions from Biomedical Literature Using Natural Language Processing Methods .2 Jiao D Z,Wild D J. Journal of Chemical Information and Modeling . 2009