采用未培养技术对荷斯坦奶牛瘤胃细菌多样性进行初步分析

被引:27
作者
王远亮
杨瑞红
毛爱军
王加启
董志扬
机构
[1] 中国科学院微生物研究所
[2] 中国农业科学院畜牧研究所
[3] 新疆农业大学农学院
[4] 中国科学院微生物研究所 北京
[5] 北京新疆农业大学农学院乌鲁木齐
[6] 北京
[7] 乌鲁木齐
关键词
瘤胃; 微生物多样性; 系统发育分析;
D O I
10.13343/j.cnki.wsxb.2005.06.020
中图分类号
S823.91 [];
学科分类号
0905 ;
摘要
采用未培养(Culture independent)技术直接从荷斯坦奶牛瘤胃液中提取瘤胃细菌微生物混合DNA(也叫元基因组DNA),利用细菌16SrDNA通用引物27F与1492R,扩增瘤胃混合微生物的16SrDNA,根据16SrDNA序列对瘤胃细菌多样性进行初步分析。通过16SrDNA序列同源性分析,发现有多于一半以上的序列与可培养的菌株的同源性小于90%,属于不可培养的菌株。选用45条测得序列与已知序列构建系统发育树,分析结果表明,它们分属于两大类LGCGPB(the lowG+CGram positivebac teria)和CFB(CytophagaFlexibacter RDSCHARDOLLARCBacteroides group),剩下的克隆尚难确定其分类地位,可能是代表新属和种的序列,这些序列已向GenBank提交并得到序列号(AY986777AY986791)。
引用
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