厌氧活性污泥微生物群落的SSCP分析条件优化

被引:7
作者
鲍立新
李建政
赵焱
郑国臣
机构
[1] 哈尔滨工业大学市政环境工程学院
基金
国家高技术研究发展计划(863计划);
关键词
分子生物学; 聚合酶链式反应; 单链构像多态性; 厌氧活性污泥; 群落结构; 牛血清白蛋白;
D O I
暂无
中图分类号
X703 [废水的处理与利用];
学科分类号
摘要
针对厌氧活性污泥微生物群落结构复杂,群落中相似基因序列较多等特点,对影响单链构像多态性(SSCP)图谱分辨率的电泳温度、甘油、交联度和影响聚合酶链式反应(PCR扩增)的BSA等因素进行了实验研究。结果表明,选择细菌16SrDNAV3区(约200bp)PCR扩增片段,在凝胶浓度为12%、丙烯酰胺与双丙烯酰胺质量比为49:1、无甘油等条件下,恒压260V,4℃电泳17h,可获得较为理想的SSCP图谱;BSA的使用,有助于降低样品中残留腐殖酸和棕黄酸等杂质对PCR扩增的抑制作用,提高SSCP图谱的分辨率和可读性,为厌氧活性污泥细菌群落结构解析提供了有效手段。
引用
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共 1 条
  • [1] Characterization of microbial diver-sity by determining terminal restriction fragment length polymorphisms of genes encoding16S rRNA .2 Liu W T,Marsh T L,Cheng H,et al. Applied Environmental Microbiology . 1997