海洋功能区划最突出的贡献,主要表现在四个方面:第一是建立起海洋功能区划的理论体系;第二是确立了一种按海洋特定区域的本质属性,即具备的功能对其实施管理的机制,这可大大提高管理工作的科学性和深刻性;第三是将科技工作的科技行为同政府工作的行政行为密切结合起来,奠定了其成果作为管理依据的地位;第四是海洋功能区划的直接作用在于为海洋开发利用、保护管理,尤其是执法监察管理提供管理依据,并具有可实施性和可操作性。海洋功能区划最显著的特点是一主导功能一区,单独划定,而不同于传统的区划和规划工作。海洋功能区划的理论体系包括:概念;海洋功能区划的范围;海洋功能区划的目的、意义;海洋功能区的分类体系;海洋功能区划的方法;划定海洋功能区的指标体系,即标准体系;海洋功能区划的原则;相关关系处理准则;海洋功能区划的组织;海洋功能区划的编制、修订、审批程序;海洋功能区划的成果要求等。