拮抗状态下α1A,α1B和α1D-肾上腺素能受体的分子模拟研究

被引:6
作者
李敏勇
卢景芬
夏霖
机构
[1] 中国药科大学药物化学教研室,北京大学天然药物与仿生药物重点实验室,中国药科大学药物化学教研室南京北京大学天然药物与仿生药物重点实验室北京,北京,南京
关键词
肾上腺素能受体; 拮抗剂; 同源模型; 分子模拟; 分子对接;
D O I
暂无
中图分类号
R91 [药物基础科学];
学科分类号
100705 [微生物与生化药学];
摘要
采用同源建模法对α1A-,α1B-和α1D-AR的三维结构进行了模拟,并采用分子力学、分子动力学方法对所得同源模型进行优化,然后分别采用训练集拮抗剂对接的方法得到拮抗状态下的α1A-,α1B-和α1D-AR三维结构模型.得到的模型再采用FRED对接软件对测试集中的18个化合物进行对接并打分,再将所得打分结果与其活性进行线性回归,其回归结果具有良好的拟合效果,由此回归方程预测的活性与化合物实验值较吻合,说明我们建立的拮抗状态下的α1A-,α1B-和α1D-AR的三维同源模型具有一定的合理性,可作为化合物虚拟筛选模型,对新化合物进行对接虚拟筛选.
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