目的了解杭州和北京两城市5岁以下流动儿童过去两周内腹泻和咳嗽的患病率及影响因素。方法在杭州市下城区和北京市朝阳区、大兴区选取流动人口居住比例较高的地区,由经过严格培训的调查员对所有符合条件的5岁以下流动儿童看护人进行问卷调查。结果共收集到3 028份5岁以下流动儿童看护人有效问卷。杭州流动儿童过去两周内腹泻和咳嗽的患病率均高于北京,且均具有统计学意义,2χ值分别为5.90和4.68,P<0.05。在控制了各种可能的危险因素后,3~5岁流动儿童腹泻的患病率是1岁以下儿童组的0.53倍,95%CI:0.42~0.68,但1~2岁和3~5岁儿童咳嗽的患病率分别是1岁以下儿童组的1.40倍,95%CI:1.12~1.75和1.78倍,95%C:I 1.46~2.16。结论两城市流动儿童过去两周内腹泻和咳嗽患病率均较高,且其患病的危险与年龄相关。