中国人类免疫缺陷病毒(HIV-1)D亚型毒株gag、env和tat基因的序列分析

被引:15
作者
邢辉
秦光明
冯毅
刘刚
潘品良
范秀娟
邵一鸣
机构
[1] 中国预防医学科学院艾滋病参比实验室,四川省卫生防疫站
关键词
人类免疫缺陷病毒(HIV).亚型,套式聚合酶链式反应(nested-PCR),序列分析系统树分析;
D O I
暂无
中图分类号
R512.91 [获得性免疫缺陷综合征(AIDS艾滋病)];
学科分类号
摘要
目的通过对HIV 1毒株gag、tat、env基因的序列分析,阐明D亚型HIV 1毒株已在中国出现。方法从1名四川非洲回国劳务人员HIV感染者(SC9712)淋巴细胞(PBMC)中提取前病毒DNA,使用套式PCR方法分别扩增HIV 1的gag基因区、env基因的C2V3区和tat基因的第一外显子。结果发现SC9712在gag区、env区和tat区与国际标准D亚型毒株的基因距离最近,其中在gag区与V1203和K31的基因离散率分别为994%和959%,在tat基因区与UG274A的基因离散率只有756%,在env区与MAL的基因离散率是1386%。系统树分析表明,SC9712与国际标准D亚型毒株、VI203、K31、MAL及UG274和Z276等非洲流行株聚在一起。结论非洲D亚型毒株已随着援外劳务人员的回国传入中国。
引用
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