人类SR蛋白超家族新成员——SFRS12(SRrp508)的基因克隆和特性分析

被引：40

作者：

张德礼

孙晓静

凌伦奖

陈润生

马大龙

机构：

[1] 北京大学人类疾病基因研究中心,国家人类基因组北方研究中心,北京大学人类疾病基因研究中心,国家人类基因组北方研究中心,中国科学院生物物理研究所,中国科学院生物物理研究所,北京大学人类疾病基因研究中心,国家人类基因组北方研究中心北京,北京,北京

来源：

遗传学报 | 2002年 / 05期

基金：

中国博士后科学基金;

关键词：

剪切因子; 调控蛋白; 人类SFRS12; 大鼠SRrp86; 人类SRrp508; 电子克隆; 生物信息学; RTPCR;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q986 [分子人类学];

学科分类号：

030303 ;

摘要：

采用生物信息学方法克隆出全长 3811bp的人类RC5 0 8cDNA片段 ,经核酸和蛋白质分析为人类新基因 (Gen Bank登记号 :AF4 5 90 94 ) ,利用RT PCR方法从人类胰脏组织中扩增出包含编码 5 0 8个氨基酸残基最大开放读码框架 (ORF)的 16 80bpcDNA片段 ,经核酸测序证明与电子克隆结果完全一致。该基因具有启动子和TATA box,ORF前同一相位有多个终子码 ,后有加尾信号 ,显示为客观存在基因。该基因含有 12个外显子 (96～ 2 0 93bp)和 11个内含子 (14 0～ 5 15 3bp) ,定位于人类 5号染色体 5q11.2～q12 .1,无任何连锁基因存在。该基因ORF 342～ 186 8(15 2 7)横跨10个外显子 ,所编码 5 0 8氨基酸蛋白的全长序列与大鼠丝氨酸精氨酸二肽富含性 (SR)剪切调控蛋白 86 (SRrp86 )高度同源 ,在核酸和蛋白水平的同源性分别为 84 %和 86 % ,与其他已知蛋白无论在核酸水平还是在氨基酸水平几乎均无整体的同源性。结果表明 ,所克隆的 5 0 8氨基酸蛋白才是大鼠SRrp86的人类同源物 ,从而修正了Barnard(2 0 0 0 )所指出的人类同源物为人类精氨酸富含性核蛋白 5 4 (p5 4 )这一论断 ,并提示它是日益增长的SR蛋白超家族的又一个新成员。该基因组织表达谱广泛 ,有可能具有转录因子活性 ,暂命名为SR相关剪切调控蛋白 5 0 8(SRrp5 0 8

引用

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