进化算法在DNA序列比对中的应用

被引:3
作者
王宏漫
欧宗瑛
机构
[1] 大连理工大学机械学院
关键词
序列比对; 进化算法; 交叉模板;
D O I
10.16337/j.1004-9037.2002.04.024
中图分类号
O224 [最优化的数学理论];
学科分类号
摘要
在对序列比对结果进行分析的过程中 ,提出了基于生物进化思想的序列比对算法。该算法的出发点是在待比对序列中的不同位置插入空位 ,通过设计合理的遗传算子 ,在不断的进化过程中 ,使序列间具有最大的相似性。由于该算法的主要操作是比较、计数和移位 ,使得硬件实现具有可行性、简易性。测试结果表明了该算法的有效性。
引用
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页数:4
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共 2 条
[1]  
遗传算法及其应用[M]. - 人民邮电出版社 , 陈国良等编著, 1996
[2]  
Combining many multiple alignments in one improved alignment .2 Klaus Bucka-Lassen,Caprani O,Hein J,et al. Bioinformatics . 1999