口腔龈上菌斑5种DNA提取方法的比较附视频

被引：4

作者：

刘莹 ^{[1
]}

吴明桃 ^{[2
]}

陈慧 ^{[3
]}

庞小燕 ^{[3
]}

赵立平 ^{[3
]}

唐子圣 ^{[1
]}

机构：

[1] 上海交通大学医学院附属第九人民医院牙体牙髓科上海市口腔医学重点实验室

[2] 上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔特需科上海市口腔医学重点实验室

[3] 上海交通大学生命科学技术学院微生物分子生态学与基因组学实验室

来源：

口腔医学 | 2011年 / 03期

关键词：

DNA提取; 变性剂梯度凝胶电泳; 龈上菌斑;

D O I：

暂无

中图分类号：

R781.4 [牙周病];

学科分类号：

100201 [内科学];

摘要：

目的寻找方便、快捷、经济、获取细菌信息量最多的细菌基因组DNA抽提方法。方法采用洗涤+冻融+BeadBeater+酚氯仿抽提法(X法)、试剂盒法(Y法)、洗涤+冻融+试剂盒法(Z法)、直接煮沸法(U法)和加Chelex-100后煮沸法(V法)5种DNA抽提方法,分别提取3例慢性牙周炎患者龈上菌斑DNA,检测DNA片段大小和浓度;同时运用变性梯度凝胶电泳分析样本微生物多样性和相似度,从多个角度对5种DNA提取方法进行评价。结果 X法DNA片段集中于3 000～20 000bp处;Y法和Z法DNA片段均匀分布于500～20 000 bp处;U法无明显DNA片段出现;V法DNA片段主要分布于500～2 000 bp处。Y法、Z法与V法所提DNA浓度较高,X法与U法所提DNA浓度较低。X法、Y法、Z法和V法反应的龈上菌斑微生物多样性无显著差异。X法、Y法和Z法的相似度较高,而V法与X法、Y法、Z法的相似度较低。结论洗涤+冻融+Bead Beater+酚氯仿抽提法,试剂盒法,洗涤+冻融+试剂盒法,加Chelex-100后煮沸法的DNA提取效果无显著差异;直接煮沸法的DNA提取效果较差。

引用

页码：144 / 147+161 +161

页数：5

共 8 条

[1]

三种粪便总DNA提取方法的比较 [J].

申剑 ;

张宝让 ;

魏华 ;

庞小燕 ;

赵立平 .

中国微生态学杂志, 2008, (01) :28-30+35

[2]

两种获取牙龈卟啉单胞菌基因组DNA方法比较 [J].

陈晓涛 ;

钟良军 ;

杨柯 ;

钱雅静 ;

李泽慧 .

新疆医科大学学报, 2007, (03) :257-259

[3]

龋齿、牙周炎患牙和健康牙的菌斑生物膜特征 [J].

李德懿 ;

富饶 ;

赵隽隽 ;

叶军 .

口腔医学, 2005, (03) :129-131

[4]

快速提取细菌DNA方法的研究 [J].

夏涵 ;

府伟灵 ;

陈鸣 ;

黄庆 ;

赵猛 ;

赵渝徽 ;

王丰 ;

罗阳 .

现代预防医学, 2005, (05) :571-573

[5]

Extremely Rapid Extraction of DNA from Bacteria and Yeasts[J] Hai-Rong Cheng;Ning Jiang Biotechnology Letters 2006,

[6]

Application of denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and temperature gradient gel electrophoresis (TGGE) in microbial ecology[J] Gerard Muyzer;Kornelia Smalla Antonie van Leeuwenhoek 1998,

[7]

牙体牙髓病学[M] 樊明文主编; 人民卫生出版社 2003,

[8]

牙周病学[M] 曹采方主编; 人民卫生出版社 2000,

← 1 →