中国第四纪哺乳动物地理区可划分为古北界的北方区及其东北亚区,属东洋界的南方区及其东部位于二者之间的过渡区。南北两个区系的雏型早已出现,但非常明确而具体,且涉及到几乎各主要哺乳动物自主要始于更新世的早期,北方区与南方区的分异在中更新世已基本稳定,其界线大约位于秦岭山嵴。晚更新世时,南北之间的界线从秦岭的某个地段转向南,沿阿坝若尔盖等地青藏高原的东缘而下,从而为现代动物地理区系的形成奠定了基础。东部过渡区大约在早更新世出现,最西达陕西蓝田或更西。之后,其范围逐步从西向东退缩。从中更新世中晚期起,随着气候的冷暖交替变化,过渡区或南或北地移动,甚至有时可达长江以南的一些地区。