非培养方法在土壤微生物生态学研究中的应用

被引:42
作者
张汉波
段昌群
屈良鹄
机构
[1] 云南大学生物学系
[2] 云南大学环境科学系
[3] 中山大学基因工程教育部重点实验室
关键词
微生物多样性; 磷脂酸; BIOLOG微量板分析; 末端限制性酶切片段长度多态性;
D O I
10.13292/j.1000-4890.2003.0124
中图分类号
S154 [土壤生物学];
学科分类号
071012 ; 0713 ;
摘要
由于有相当数量的土壤微生物是目前不可培养的 ,因此利用传统培养技术来研究土壤微生物 ,不仅费时费力 ,所得到的结果可能和真实的情况相差甚远。近年来发展了三类不需培养的方法来研究土壤微生物的种类和数量 ,这些方法大体上分为生物化学、生理学和分子生物学三类。生物化学方法主要根据细胞膜磷脂酸 (PLFA)的种类和数量来判定微生物的多样性 ;BIOLOG微量板分析系统是生理学方法的代表 ,它主要是根据土样细胞悬液对 95种单一碳源的利用模式来说明群落结构的变化 ;分子生物学方法是发展应用最广的方法 ,基本步骤是提取土壤的总DNA ,然后用通用引物或选择性高的引物来扩增 16SrRNA基因。由于对扩增产物分析方法的不同 ,该方法又可分为PCR DGGE ,PCR RFLP等。最近在PCR RFLP基础上发展起来的T RFLP分析方法 ,将微生物的多样性分析工作同RDP(ribosomaldatabaseproject)数据库结合 ,充分利用了Internet的数据资源共享的优势 ,具有分辨率高 ,可实现自动化等优点 ,是未来土壤微生物生态学研究的有力工具。
引用
收藏
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