反硝化功能基因——检测反硝化菌种群结构的分子标记

被引：20

作者：

梁丽华 ^{[1
,2
]}

左剑恶 ^{[1
]}

机构：

[1] 清华大学环境科学与工程系

[2] 西北大学环境科学系

来源：

微生物学通报 | 2009年 / 36卷 / 04期

关键词：

反硝化菌; 功能基因; 种群结构;

D O I：

10.13344/j.microbiol.china.2009.04.015

中图分类号：

X703 [废水的处理与利用];

学科分类号：

摘要：

反硝化菌种类繁多,且分属多个分类学上的不同种属,故不能利用常规的16SrRNA测序方法对其进行研究。利用编码反硝化酶的功能基因作为分子标记,可以有效研究环境样品中反硝化菌的种群结构、数量以及活性等。本文重点介绍了主要的反硝化功能基因以及常用的扩增引物,分析了反硝化功能基因与16SrRNA系统发育之间的关系,比较了nirS和nirK基因菌的群落分布特征,对目前反硝化功能基因的研究和应用现状进行了综述,讨论了研究中发现的新问题,期望为研究复杂微生物的生态特征提供参考。

引用

页码：627 / 633

页数：7

共 10 条

[1] 污水生物处理功能微生物的多样性 [J].

叶姜瑜 ;

罗固源 ;

吉芳英 ;

王希 ;

王丹云 .

重庆大学学报(自然科学版), 2005, (10) :122-126

[2] Isolation of denitrifying bacteria from hydrocarbon-contaminated Antarctic soil [J].

Powell, Shane M. ;

Ma, Wai K. ;

Siciliano, Steven D. .

POLAR BIOLOGY, 2006, 30 (01) :69-74

[3] Changes in bacterial community structure correlate with initial operating conditions of a field-scale denitrifying fluidized bed reactor [J].

Hwang, C. ;

Wu, W. -M. ;

Gentry, T. J. ;

Carley, J. ;

Carroll, S. L. ;

Schadt, C. ;

Watson, D. ;

Jardine, P. M. ;

Zhou, J. ;

Hickey, R. F. ;

Criddle, C. S. ;

Fields, M. W. .

APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2006, 71 (05) :748-760

[4]

Characterization of Molybdenum-Free Nitrate Reductase from Haloalkalophilic Bacterium Halomonas sp. Strain AGJ 1-3[J] . A. N. Antipov,E. V. Morozkina,D. Yu. Sorokin,L. I. Golubeva,R. A. Zvyagilskaya,N. P. L’vov.Biochemistry （Moscow） . 2005 (7)

[5] Finding the missing link between diversity and activity using denitrifying bacteria as a model functional community [J].