为建立长穗偃麦草(Lophopyrum elongatum)Ee染色体组特异的分子标记,以普通小麦(Triticum aestivum)中国春、中国春-长穗偃麦草二体代换系和附加系为材料,用5对扩增片段长度多态性(AFLP)引物进行分析,共筛选出28个分布于1 ̄7Ee7个染色体特异的AFLP标记,经PAGE凝胶电泳后回收、克隆和测序,并根据测序结果设计PCR特异引物,成功地将AFLP标记E-ATC/M-CGTA341bp,E-ATT/M-CTAG265bp,E-AAT/M-CCAG139bp和E-ATT/M-CTAG205bp转化为实验结果稳定、操作更简单的序列标记位点(STS)标记。利用获得的STS标记对5个长穗偃麦草居群和8个小麦品种进行了鉴定。结果表明,这些STS标记在长穗偃麦草居群中检测到,但在其它小麦背景中检测不到。表明这些标记可以用于小麦-长穗偃麦草异源附加系和代换系中长穗偃麦草遗传物质的检测。