苦楝丛枝植原体质粒的测定与分子特征

被引：17

作者：

宋传生 ^{[1
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林彩丽 ^{[1
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田国忠 ^{[1
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赵文军 ^{[2
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朱水芳 ^{[2
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牟海青 ^{[2
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胡佳续 ^{[1
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王曦茁 ^{[1
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郭民伟 ^{[1
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机构：

[1] 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室

[2] 中国检验检疫科学研究院动植物检疫研究所

来源：

微生物学报 | 2011年 / 51卷 / 09期

关键词：

苦楝丛枝植原体; 质粒; 序列分析; 系统进化; DNA杂交;

D O I：

10.13343/j.cnki.wsxb.2011.09.003

中图分类号：

S763.7 [各种树的病虫害及其防治];

学科分类号：

090703 [森林保护学];

摘要：

【目的】测定苦楝丛枝植原体(CWB植原体)质粒并分析其分子特征。【方法】扩增苦楝丛枝植原体质粒片段并进行系统进化分析,预测质粒编码蛋白的跨膜区、亚细胞定位;以质粒pCWBFq repA为模板制备探针,利用Southern blot方法检测苦楝丛枝植原体及其他几种植原体的质粒。【结果】测定了苦楝丛枝植原体福清株系的一个质粒pCWBFq,该质粒全长4446 bp,A+T含量为73.5%,编码6个蛋白,其中pCWBFq P2-P5五个编码蛋白分别含有3、2、1和2个跨膜区,其信号肽(Singnal Peptide,SP)信号值分别为0.989、0.505、0.918和0.914。氨基酸序列相似性比较表明:pCWBFq RepA蛋白与其他植原体质粒RepA的同源性在9.6%-85.6%之间,而pCWBFq SSB蛋白与其他植原体质粒SSB的同源性在74.0%-89.4%之间。用pCWBFq repA探针检测到苦楝丛枝植原体中质粒的存在,同时也能够检测到16SrI组的泡桐丛枝植原体(PaWBNy),海南长春花绿变植原体(PeVHn),苦楝丛枝植原体福州株系(CWBFz)和桑树萎缩植原体濮阳株系(MDPy)中的质粒,但16SrV组的枣疯植原体北京株系(JWBBj)、樱桃致死黄化西昌株系(CLYXc)和重阳木丛枝南昌株系(BiWBNc)中未能检测到任何杂交信号。【结论】苦楝丛枝植原体质粒pCWBFq编码的6个蛋白中,除与质粒复制有关的RepA和SSB外,另外4个均为含有疏水结构的分泌蛋白或膜蛋白。植原体质粒的同源基因间存在程度不同的变异,其中repA基因在所有植原体质粒上均存在,但变异性相对较大,而ssb基因仅存在于16SrI组植原体质粒中,且变异相对较小。16SrI组的CWBFq、PaWBNy、PeVHn、CWBFz和MDPy中均存在数量和大小不同的质粒,而16SrV组的JWBBj、CLYXc和BiWBNc中或含有的质粒因与pCWBFq repA探针的同源性较低而不能被检测到。

引用

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页数：10

共 13 条

[1]

中国各地不同枣树品种上枣疯病植原体的PCR检测及分子变异分析 [J].