微生物生态研究中基于BIOLOG方法的数据分析

被引：103

作者：

王强 ^{[1
]}

戴九兰 ^{[2
]}

吴大千 ^{[1
]}

余悦 ^{[1
]}

申天琳 ^{[1
]}

王仁卿 ^{[1
,2
]}

机构：

[1] 山东大学生命科学学院

[2] 山东大学环境研究院

来源：

生态学报 | 2010年 / 30卷 / 03期

关键词：

BIOLOG; 多元统计; 环境微生物; 数据分析; 微生物生态;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q938 [微生物生态学和地区分布];

学科分类号：

071005 ; 100705 ;

摘要：

BIOLOG微平板法作为一种方便快速的微生物检验技术,已广泛应用于环境微生物检测,微生物生态研究等方面,发挥着越来越重要的作用。该方法可以获得关于微生物群落碳源利用能力的大量数据,反映出关于微生物活性的丰富信息。然而大量的数据也对解释和分析提出了挑战,分析了应用于BIOLOG产生数据的统计分析方法,对常用的AWCD值计算,多样性指数计算,主成分分析(PCA),聚类分析,相关、回归等方法深入探讨,阐述各自的功能、不足以及在应用中容易出现的问题。另外也对一些不常见的方法,如非参数多元分析(Non-Parametric version of MANOVA/Permutation version of MANOVA)、动力学参数分析、多元回归树、典范对应分析等也进行了讨论。通过对不同方法应用目标和原理的分析论述了各自优缺点,对微生物研究中基于BIOLOG方法数据分析的选择应用提供参考。

引用

页码：817 / 823

页数：7

共 23 条

[1] 不同生态条件下油松(Pinus tabulaeformis)菌根根际土壤微生物群落 [J].

张海涵 ;

唐明 ;

陈辉 ;

杜小刚 ;

郑华 .

生态学报, 2007, (12) :5463-5470

[2]

Effects of vegetation type on soil microbial community structure and catabolic diversity assessed by polyphasic methods in North China[J]. HAN Xue-mei~1 WANG Ren-qing~(1,2) LIU Jian~2 WANG Meng-cheng~1 ZHOU Juan~1 GUO Wei-hua~(1,*) 1.School of Life Sciences,Shandong University,Jinan 250100,China 2.Institute of Environment Research,Shandong University,Jinan 250100,China.Journal of Environmental Sciences. 2007(10)

[3] 恩诺沙星对土壤微生物群落功能多样性的影响 [J].

马驿 ;

陈杖榴 ;

曾振灵 .

生态学报, 2007, (08) :3400-3406

[4] Microbial communities in microcosm soils treated with battery waste [J].

Han Xuemei Guo Weihua Wang Renqing Wang Mengcheng College of Life SciencesShandong UniversityJinan China .

Progress in Natural Science, 2007, (08) :919-926

[5] 不同施肥处理与地膜覆盖对土壤微生物群落功能多样性的影响 [J].

侯晓杰 ;

汪景宽 ;

李世朋 .

生态学报, 2007, (02) :655-661

[6]

SPSS统计分析高级教程[M]. 高等教育出版社 , 张文彤主编, 2004

[7]

New and Current Microbiological Tools for Ecosystem Ecologists: Towards a Goal of Linking Structure and Function[J] . Drenovsky, Rebecca E,Feris, Kevin P,Batten, Katharine M,Hristova, Krassimira.The American Midland Naturalist . 2008 (1)

[8] Multivariate analyses in microbial ecology [J].

Ramette, Alban .

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 2007, 62 (02) :142-160

[9] Toward an ecological classification of soil bacteria [J].

Fierer, Noah ;

Bradford, Mark A. ;

Jackson, Robert B. .

ECOLOGY, 2007, 88 (06) :1354-1364

[10] Simplicity and complexity in ecological data analysis [J].

Murtaugh, Paul A. .

ECOLOGY, 2007, 88 (01) :56-62

← 1 2 3 →