双龙方有效成分诱导干细胞分化过程中差异表达基因的筛选和聚类分析

被引：20

作者：

王金津 ^{[1
]}

钱夕元 ^{[1
]}

李雪 ^{[2
]}

杨辉华 ^{[2
]}

梁琼麟 ^{[2
]}

王义明 ^{[2
]}

罗国安 ^{[2
]}

机构：

[1] 华东理工大学理学院

[2] 清华大学中药现代化研究中心

来源：

世界科学技术-中医药现代化 | 2007年 / 03期

关键词：

双龙方; 基因芯片; 差异基因表达; hierarchical聚类分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

R285.5 [中药实验药理];

学科分类号：

100806 [中药药理学];

摘要：

目的:利用基因芯片筛选双龙方主要成分(人参皂苷Rb1,丹参酚酸B)诱导大鼠骨髓间充质干细胞(MSCs)分化过程中的差异表达基因,并对差异表达基因进行聚类分析,研究双龙方主要有效成分对大鼠MSCs增殖及分化的影响。方法:用含5705条大鼠基因的博奥大鼠全基因组Oligo芯片,以不同给药情况、不同时间点的细胞总RNA制备的探针杂交芯片,用LuxScan10KA双通道激光扫描仪(CapitalBio公司)进行扫描,筛选MSCs变化过程中的差异表达基因并进行生物信息分析,hierarchical聚类提取差异表达的特征基因。结果:在MSCs的分化过程中,筛选出128条(2.24%)差异表达基因,经分析发现它们与能量代谢,信号传导等多类基因密切相关,对样本进行聚类发现MSCs在20-30天之间发生了显著的改变。结论:基因芯片是研究中药作用机理的有效平台,双龙方主要成分可诱导MSCs向心肌样细胞分化。

引用

页码：39 / 42+66 +66

页数：5

共 8 条

[1]

5-氮胞苷诱导间质干细胞为心肌细胞的实验研究 [J].